锡林郭勒盟机构编制委员会办公室是锡林郭勒盟机构编制委员会的常设办事机构，既是锡盟委的工作机构，又是锡盟行署的工作机构，列锡盟委工作机构序列，在锡盟委、锡盟行署和锡盟编委的领导下，具体负责全盟行政管理体制、机构改革、事业单位管理体制及机构改革和机构编制日常管理工作。锡林郭勒盟机构编制委员会办公室在2002年党政机关机构改革中独立设置。
锡林郭勒盟机构编制委员会办公室主要职责是：贯彻执行自治区党委、政府关于行政、事业管理体制和机构改革、机构编制管理的方针、政策和法律法规，研究拟订全盟行政、事业管理体制和机构改革方案及机构编制管理的方案、办法，并监督实施；统一管理全盟各级党政机关、人大、政协、法院、检察院、各民主党派、人民团体及事业单位的机构编制；负责全盟各级机关、事业单位机构编制日常管理工作；负责全盟事业单位法人登记管理工作；负责承办盟委、行署、盟编委交办的有关事宜。